《本草纲目》共有52卷 ， 载有药物1892种 ， 其中载有新药374种 ， 收集医方11096个 ， 书中还绘制了l111幅精美的插图 ， 是我国医药宝库中的一份珍贵遗产 。 它的成就 ， 首先在药物分类上改变了原有上、中、下三品分类法 ， 采取了“析族区类 ， 振纲分目”的科学分类 。 它把药物分矿物药、植物药、动物药 。 又将矿物药分为金部、玉部、石部、卤部四部 。 植物药一类 ， 根据植物的性能、形态、及其生长的环境 ， 区别为草部、谷部、菜部、果部、木部等5部；革部又分为山草、芳草、醒草、毒草、水草、蔓草、石草等小类 。 动物一类 ， 按低级向高级进化的顺序排列为虫部、鳞部、介部、禽部、兽部、人部等6部 。 还有服器部 。 《本草纲目》共分为16部62类 。 这种分类法 ， 已经过渡到按自然演化的系统来进行了 。 从无机到有机 ， 从简单到复杂 ， 从低级到高级 ， 这种分类法在当时是十分先进的 。 尤其对植物的科学分类 ， 要比瑞典的分类学家林奈早二百年 。
《本草纲目》不仅在药物学方面有巨大成就 ， 在化学、地质、天文等方面 ， 都有突出贡献 。 它在化学史上 ， 较早地记载了纯金属、金属、金属氯化物、硫化物等一系列的化学反应 。 同时又记载了蒸馏、结晶、升华、沉淀、干燥等现代化学中应用的一些操作方法 。 李时珍还指出 ， 月球和地球一样 ， 都是具有山河的天体 ， “窃谓月乃阴魂 ， 其中婆娑者 ， 山河之影尔” 。 《本草纲目》不仅是我国一部药物学巨著 ， 也不愧是我国古代的百科全书 。 正如李建元《进本草纲目疏》中指出：“上自坟典、下至传奇 ， 凡有相关 ， 靡不收采 ， 虽命医书 ， 实该物理 。 ”
《本草纲目》编写后 ， 李时珍希望早日出版 ， 为了解决《本草纲目》的出版问题 ， 70多岁的李时珍 ， 从武昌跑到当时出版业中心南京 ， 希望通过私商来解决 。 由于长年的辛苦劳累 ， 李时珍终于病例在床 ， 病中嘱咐他的孩子们 ， 将来把《本草纲目》献给朝廷 ， 借助朝廷的力量传布于世 。 可惜李时珍还没有见到《本草纲目》的出版 ， 就与世长辞了 。 这年(1593年) ， 他刚满76岁 。
不久 ， 明朝皇帝朱诩钧 ， 为了充实国家书库 ， 下令全国各地向朝廷献书 ， 李时珍的儿子李建元 ， 将《本草纲目》献给朝廷 。 朝廷批了“书留览、礼部知道”七个字 ， 就把《本草纲目》搁置一边 。 后来仍在南京的私人刻书家胡承龙的刻印下 ， 在李时珍死后的第3年(1596年) ， 《本草纲目》出版 。 公元1603年 ， 《本草纲目》又在江西翻刻 。 从此 ， 在国内得到广泛的传播 。 据不完全统计 ， 《本草纲目》在国内至今有三十多种刻本 。
公元1606年《本草纲目》首先传入日本 ， 1647年波兰人弥格来中国 ， 将《本草纲目》译成拉丁文流传欧洲 ， 后来又先后译成日、朝、法、德、英、俄等文字 。
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