在这些年里阿奎纳每天不停的进行传教 ， 并且写下许多的训诫、问答集、以及授课笔记 。 他也开始撰写他的大作《神学大学》 。 教会曾提供他那不勒斯的大主教和卡西诺山修道院院长的职位 ， 但都被他婉拒了 。
1273年12月6日的一次弥撒仪式中 ， 阿奎纳还称自己看见了神迹 。 事后他停止写作 ， 使得《神学大全》变成未完成作品 。 当被问及为何封笔时 ， 阿奎纳答道：“我写不下去了……与我所见和受到的启示相比 ， 我过去所写的一切犹如草芥 。 ”后来有人称阿奎纳在祷告时听到了来自十字架的声音 ， 称赞他的写作 。 还有修道士宣称曾看到他凌空飘起 。
据同时代的人描述 ， 阿奎纳是个大块头 ， 肥胖而且皮肤黝黑 ， 头颅硕大 ， 发髻很高 。 他的为人处世表现出很好的教养：众人认为他举止端正 ， 温文尔雅 ， 而且令人如沐春风 。 在争论中 ， 他保持克制 ， 并且用人格魅力和渊博的学识赢得对手的尊重 。 他品位朴素 ， 周围的人为其出色的记忆力所倾倒 。 在他沉思时 ， 常对周遭的环境浑然不知 。 他能够系统、清晰和简明地表达他人的意见 ， 使自己的思想富有热情而且兼收并蓄 。 在另一方面 ， 他经常对于自己著作的数量不足感到遗憾 ， 因为他认为他所受到的神的启示远远不只这些 。
3、去世和封圣
在1274年1月 ， 额我略十世指派阿奎纳参加第二次里昂会议 。 他的工作是调查并且研究出希腊与拉丁教会之间的差异 。 身体状况已经相当差的阿奎纳在前往会议的旅程中停留于一座侄女的城堡中 ， 病况开始恶化 。 阿奎纳希望在修道院里走完人生旅程 ， 但却无法及时抵达多明我会的教堂 ， 最后他被带至一座熙笃会的教堂 。 在经历七周的病痛煎熬后 ， 于1274年3月7日去世 。
但丁(Purg. xx. 69)引用阿奎纳的一个友人的说法 ， 宣称阿奎纳是被西西里国王查理斯一世（Charles I of Sicily）下令毒死的 。 不过 ， 历史学家Antonio Muratori重新找出了这段朋友的记载 ， 但却没有发现任何有关阴谋论的叙述 。
所有与阿奎纳相识的人都对他印象深刻 。 他获得了教会赐予的“天使博士”（doctor angelicus）的头衔 。 但丁在神曲中将阿奎纳布置在第四层天堂 ， 与其他伟大的宗教思想家并列一堂 。 在1319年 ， 天主教教会开始调查将阿奎纳封圣的可能性 。 若望二十二世在1323年6月18日于亚维农正式宣布将阿奎纳封为圣人 。 在1567年 ， 庇护五世将圣托马斯·阿奎纳日与其他四名最伟大的拉丁神学家：安波罗修、杰罗姆、圣奥古斯丁、葛利格理并列 。
阿奎纳的《神学大全》被教会视为最重要的著作之一 ， 在第十九届大公会议上它还被与圣经和教谕（Decretal）并列 。 他在神学思想发展上的重要性只有圣奥古斯丁能够相提并论 。 良十三世在1879年8月4日的教皇通谕里还指出阿奎纳的神学是构成天主教思想的关键著作 ， 也因此他下令将阿奎纳的著作立为天主教会的思想基础 ， 所有的天主教学院和大学都必须教导阿奎纳的理论 ， 并且还建议教师们在谈及那些阿奎纳没有明白阐述到的议题时 ， 应该要“遵从阿奎纳的思考方式 ， 教导正确的结论” 。
在1880年 ， 阿奎纳被封为所有天主教教育机构的主保圣人 。 在今天 ， 一座位于那不勒斯的修道院还留有一间据传阿奎纳住过的小房间 ， 开放供游客参观 。 阿奎纳的圣人日后来被改到了1月28日 ， 不过许多人还是将3月7日他去世的那天视为他的圣人日 。 阿奎纳的遗体在1369年被移至法国图卢兹的雅各宾教堂安葬 ， 在1789年至1974年间曾被移至另一间会堂 ， 但在1974年又被移回雅各宾教堂直到今日 。
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